<div dir="ltr">Hi folks,<div><br></div><div>I'm trying to package up a complex system and would like to do it the correct, modern way.</div><div><br></div><div>In particular, this involves a bunch of compiled extensions, as well as dependencies on both the scientific "stack" and common Web app packages.</div><div><br></div><div>(can you tell I'm building a web service front-end for computational code?)</div><div><br></div><div>This is actually a bit of a trick, because the web development community is generally doing a good job up supporting PyPi and pip, whereas the complications of the scientific software tools have folks relying more on tools like Enthought and Continuum.</div><div><br></div><div>So far, we've been doing mostly pip and struggling with build our own for the ugly scientific stuff (whoo hoo, fun with HDF and netcdf, and GDAL, and....). But at the end of all this we'd like to be able to distribute and make it easy on end users to use our tools.</div><div><br></div><div>I figure we we'll do one (or both) of:</div><div>- providing a custom "wheel house" with our packages and the dependencies that are hard to come by</div><div>- provide a binstar channel with conda packages of all the same stuff but a totally different set of "other" packages.</div><div><br></div><div>At the moment, I'm working on making conda packages, which brings me to my questions.</div><div><br></div><div>I'm a bit confused about the role of setuptools with pip. On the one hand, pip depends of setuptools. On the other hand, pip supposed doesn't "do" eggs, and prefers wheels. But I find that I keep getting eggs whether I want them or not. IN fact, as far as I can tell, the way to get pip to instal something from git repo is:</div><div><br></div><div>git+<a href="https://url_to_the_repo.git#egg=name_of_package">https://url_to_the_repo.git#egg=name_of_package</a><br></div><div><br></div><div>why isn't that "wheel=name_of_package"</div><div><br></div><div>and will it work if setuptools was not used in the packages setup.py???</div><div><br></div><div>Frankly I've generally found setuptools and eggs to be overly heavy weight and annoying -- the only reason I use setuptools at all is that I REALLY like develop mode -- which I can now get with "pip --editable" or Â does that give me setuptools develop mode anyway, i.e. do I need to have used setuptools.setup for it to work?</div><div><br></div><div>So question one: do I need to use setuptools.setup rather than plain old distutils.setup?</div><div><br></div><div>Question 2:</div><div><br></div><div>What about setuptools: "install_requires"</div><div><br></div><div>I generally like the pip requirements.txt approach. It's up to the installation tool, not the packaging tool to mange requirements. But then again, it does make sense to declare the requirements in setup.py. But the issue at hand is that install_requires is doing some odd things with conda:</div><div><br></div><div>conda, of course, is designed to manage dependencies itself, and those are declared in the conda build meta.yaml file. Note that conda dependencies can have nothign to do with python -- the whole point of conda -- a conda pacakge can depend on any other conda package, including C libs, etc.</div><div><br></div><div>But the issue at hand is that conda build doesn't re-invent setup.py -- but rather you generally simple call "setup.py install" from your conda build script. Hence th issue at hand:</div><div><br></div><div>Using setuptools.setup, and specifying "install_requires", then kicks in setuptools trying to resolve dependencies I don't want it to deal with.</div><br>I read Donald's "setup.py vs requirements.txt", and I guess I get it, but it still seems quite redundant -- I see the point of separating out Â â€œabstract dependencies” and Â â€œconcrete dependencies”. However, the nifty solution of only putting:<div><br></div><div><font face="monospace, monospace">--index-url <a href="https://pypi.python.org/simple/">https://pypi.python.org/simple/</a><br></font></div><div><font face="monospace, monospace"><br></font></div>in the requirements.txt doesn't work for complex cases. In practice, we find we need to specify version numbers of some dependencies, and have some go strait into a git repo, etc. So we need a messy requirements.txt file.<div><br></div><div>And, in fact, I think that's where is belongs -- the goal of the requirements.txt file is so pip can "do the right thing" and go grab everything you need. But, in fact, it also is quite human readable, and serves quite well as the documentation for the "abstract dependencies" as well.</div><div><br></div><div>So I think the way to go is to keep requirements in requirements.txt, and leave them out of the setup.py.</div><div><br></div><div>Can I dump setuptools.setup, as well??</div><div><br></div><div>Sorry, this is a bit rambling and short of clear questions, but I'm trying to get a handle on what best practices really are these days...</div><div><br></div><div>-Chris<br><div><br></div><div><br></div><div><div><div><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><br>Christopher Barker, Ph.D.<br>Oceanographer<br><br>Emergency Response Division<br>NOAA/NOS/OR&R Â  Â  Â  Â  Â  Â (206) 526-6959   voice<br>7600 Sand Point Way NE Â Â (206) 526-6329   fax<br>Seattle, WA Â 98115 Â  Â  Â Â (206) 526-6317   main reception<br><br><a href="mailto:Chris.Barker@noaa.gov" target="_blank">Chris.Barker@noaa.gov</a></div>
</div></div></div></div></div>