<div dir="ltr"><div>I have put together a MWE that demonstrates the problem I have.<br><br></div>When you have a markdown cell with $>$ in it, it cannot be converted properly to PDF using LaTeX.  I was able to work around by moving the greater than symbol out of math mode, but this smells like a bug to me.<br>

<div><br></div><div>The file and the error I get are below.<br></div><div><br>Ian<br><br>The ipynb contents are <br>{<br> "metadata": {<br>  "name": ""<br> },<br> "nbformat": 3,<br>

 "nbformat_minor": 0,<br> "worksheets": [<br>  {<br>   "cells": [<br>    {<br>     "cell_type": "markdown",<br>     "metadata": {},<br>     "source": [<br>

      "$A>B$"<br>     ]<br>    },<br>    {<br>     "cell_type": "code",<br>     "collapsed": false,<br>     "input": [],<br>     "language": "python",<br>

     "metadata": {},<br>     "outputs": []<br>    }<br>   ],<br>   "metadata": {}<br>  }<br> ]<br>}<br><br></div><div>and the error is :<br><br>C:\Users\Belli\Documents\Code\CoolProp\doc\notebooks>ipython nbconvert --to latex --post PDF bad_gt.ipynb<br>

[NbConvertApp] Using existing profile dir: u'C:\\Users\\Belli\\.ipython\\profile_default'<br>[NbConvertApp] Converting notebook bad_gt.ipynb to latex<br>[NbConvertApp] Support files will be in bad_gt_files\<br>[NbConvertApp] Loaded template latex_article.tplx<br>

[NbConvertApp] Writing 11619 bytes to bad_gt.tex<br>[NbConvertApp] Building PDF<br>[NbConvertApp] Running pdflatex 3 times: ['pdflatex', 'bad_gt.tex']<br>[NbConvertApp] CRITICAL | pdflatex failed: ['pdflatex', 'bad_gt.tex']<br>

This is pdfTeX, Version 3.1415926-2.5-1.40.14 (MiKTeX 2.9)<br>entering extended mode<br>(C:\Users\Belli\Documents\Code\CoolProp\doc\notebooks\bad_gt.tex<br>LaTeX2e <2011/06/27><br>Babel <v3.8m> and hyphenation patterns for english, afrikaans, ancientgreek, ar<br>

abic, armenian, assamese, basque, bengali, bokmal, bulgarian, catalan, coptic,<br>croatian, czech, danish, dutch, esperanto, estonian, farsi, finnish, french, ga<br>lician, german, german-x-2013-05-26, greek, gujarati, hindi, hungarian, iceland<br>

ic, indonesian, interlingua, irish, italian, kannada, kurmanji, latin, latvian,<br> lithuanian, malayalam, marathi, mongolian, mongolianlmc, monogreek, ngerman, n<br>german-x-2013-05-26, nynorsk, oriya, panjabi, pinyin, polish, portuguese, roman<br>

ian, russian, sanskrit, serbian, slovak, slovenian, spanish, swedish, swissgerm<br>an, tamil, telugu, turkish, turkmen, ukenglish, ukrainian, uppersorbian, usengl<br>ishmax, welsh, loaded.<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\base\article.cls"<br>

Document Class: article 2007/10/19 v1.4h Standard LaTeX document class<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\base\size10.clo"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\graphics\graphicx.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\graphics\keyval.sty")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\graphics\graphics.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\graphics\trig.sty")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\00miktex\graphics.cfg")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\pdftex-def\pdftex.def"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\infwarerr.sty")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\ltxcmds.sty"))))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\adjustbox\adjustbox.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\xkeyval\xkeyval.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\xkeyval\xkeyval.tex"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\adjustbox\adjcalc.sty")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\adjustbox\trimclip.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\collectbox\collectbox.sty")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\adjustbox\tc-pdftex.def"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\ifoddpage\ifoddpage.sty")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\ltxmisc\varwidth.sty"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\graphics\color.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\00miktex\color.cfg"))<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\tools\enumerate.sty")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\geometry\geometry.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\ifpdf.sty")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\ifvtex.sty")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\ifxetex\ifxetex.sty")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\geometry\geometry.cfg"))<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsmath\amsmath.sty"<br>For additional information on amsmath, use the `?' option.<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsmath\amstext.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsmath\amsgen.sty"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsmath\amsbsy.sty")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsmath\amsopn.sty"))<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsfonts\amssymb.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsfonts\amsfonts.sty"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\base\inputenc.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\base\utf8.def"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\base\t1enc.dfu")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\base\ot1enc.dfu")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\base\omsenc.dfu")))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\ucs\ucs.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\ucs\uni-global.def"))<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\fancyvrb\fancyvrb.sty"<br>Style option: `fancyvrb' v2.7a, with DG/SPQR fixes, and firstline=lastline fix<br><2008/02/07> (tvz))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\oberdiek\grffile.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\oberdiek\kvoptions.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\kvsetkeys.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\etexcmds.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\ifluatex.sty"))))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\pdftexcmds.sty"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\hyperref\hyperref.sty"<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\hobsub-hyperref.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\hobsub-generic.sty"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\oberdiek\auxhook.sty")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\hyperref\pd1enc.def")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\00miktex\hyperref.cfg")<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\url\url.sty"))<br>

<br>Package hyperref Message: Driver (autodetected): hpdftex.<br><br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\hyperref\hpdftex.def"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\oberdiek\rerunfilecheck.sty"))<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\tools\longtable.sty")<br>No file bad_gt.aux.<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\context\base\supp-pdf.mkii"<br>[Loading MPS to PDF converter (version 2006.09.02).]<br>

)<br>*geometry* driver: auto-detecting<br>*geometry* detected driver: pdftex<br><br>Package geometry Warning: The marginal notes overrun the paper.<br>     Add 3.73001pt and more to the right margin.<br><br>*geometry* verbose mode - [ preamble ] result:<br>

* driver: pdftex<br>* paper: <default><br>* layout: <same size as paper><br>* layoutoffset:(h,v)=(0.0pt,0.0pt)<br>* modes:<br>* h-part:(L,W,R)=(72.26999pt, 469.75502pt, 72.26999pt)<br>* v-part:(T,H,B)=(72.26999pt, 650.43001pt, 72.26999pt)<br>

* \paperwidth=614.295pt<br>* \paperheight=794.96999pt<br>* \textwidth=469.75502pt<br>* \textheight=650.43001pt<br>* \oddsidemargin=0.0pt<br>* \evensidemargin=0.0pt<br>* \topmargin=-37.0pt<br>* \headheight=12.0pt<br>* \headsep=25.0pt<br>

* \topskip=10.0pt<br>* \footskip=30.0pt<br>* \marginparwidth=65.0pt<br>* \marginparsep=11.0pt<br>* \columnsep=10.0pt<br>* \skip\footins=9.0pt plus 4.0pt minus 2.0pt<br>* \hoffset=0.0pt<br>* \voffset=0.0pt<br>* \mag=1000<br>

* \@twocolumnfalse<br>* \@twosidefalse<br>* \@mparswitchfalse<br>* \@reversemarginfalse<br>* (1in=72.27pt=25.4mm, 1cm=28.453pt)<br><br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\ucs\ucsencs.def")<br><br>Package ucs Warning: ***************************<br>

(ucs)                You seem to have loaded inputencoding utf8<br>(ucs)                (LaTeX kernel UTF-8) instead of utf8x (ucs.sty UTF-8).<br>(ucs)                Probably you are compiling a document written for a<br>

(ucs)                pre-august-2004 ucs.sty.<br>(ucs)                ***************************<br>(ucs)                Please use \usepackage[utf8x]{inputenc} instead of<br>(ucs)                \usepackage[utf8]{inputenc}.<br>

(ucs)                ***************************<br>(ucs)                If you should really want to use ucs.sty and kernel's<br>(ucs)                utf8.def together, use \usepackage[utf8x,utf8]{inputenc}<br>(ucs)                to disable compatibility mode<br>

(ucs)                ***************************<br>(ucs)                Activating compatibility mode.<br>(ucs)                ***************************<br>(ucs)                 on input line 218.<br><br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\ucs\utf8x.def")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\hyperref\nameref.sty"<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\generic\oberdiek\gettitlestring.sty"))<br>("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsfonts\umsa.fd")<br>

("C:\Program Files (x86)\MiKTeX 2.9\tex\latex\amsfonts\umsb.fd")<br><br>LaTeX Warning: No \author given.<br><br>! Misplaced alignment tab character &.<br>l.226     $A&<br>             gt;B$<br>?<br>! Emergency stop.<br>

l.226     $A&<br>             gt;B$<br>!  ==> Fatal error occurred, no output PDF file produced!<br>Transcript written on bad_gt.log.<br><br>[NbConvertApp] Removing temporary LaTeX files<br><br></div></div>