<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 27, 2015 at 10:44 AM, Gael Varoquaux <span dir="ltr"><<a href="mailto:gael.varoquaux@normalesup.org" target="_blank">gael.varoquaux@normalesup.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">On Mon, Jul 27, 2015 at 08:56:08AM -0700, Ariel Rokem wrote:<br>
>     PS: Vanessa: Nilearn is not only for fMRI. It's for statistical analysis<br>
>     of images. It is also used for anatomical images:<br>
>     <a href="http://nilearn.github.io/auto_examples/decoding/plot_oasis_vbm.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://nilearn.github.io/auto_examples/decoding/plot_oasis_vbm.html</a><br>
>     If we could get a preprocessed, openly downloadable set of images of eg<br>
>     FA, we would do an example with diffusion too.<br>
<br>
> Completely off-topic, but I can't resist: if only there was an<br>
> open-source project that computed FA images from freely available<br>
> diffusion MRI data-sets! <br>
<br>
Well, you're welcome to help us with preprocessing and pitching a<br>
relevant prediction problem from this data. I know nothing about<br>
diffusion and nothing about the datasets you are talking about. In my<br>
experience, writing a relevant example requires understanding the data<br>
and the questions. If you, or someone else, gets us to the point where<br>
there is a set of nifti images of FA with condition A and condition B,<br>
and helps us write the story, than we have an example.<br></blockquote><div><br></div><div>Hmm. Interesting idea. I am looking around for something along these lines. I think that there are some freely available data-sets that are already preprocessed, so could be used in this way. Let me think about how to go about this.  </div><div> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Gaël<br>
_______________________________________________<br>
Neuroimaging mailing list<br>
<a href="mailto:Neuroimaging@python.org" target="_blank">Neuroimaging@python.org</a><br>
<a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging</a><br>
</blockquote></div><br></div></div>