<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>Just wanted to give you a quick feedback about the meeting we had with Jon to try and install DIPY for development work in Windows 10 (64bit) using an Anaconda installation.</div><div><br></div><div>What we found is that if you are using recent Anaconda in Windows you do not need to install mingw or libpython (with conda). All you need after or before installing Anaconda is to install one of the free versions (or not) of the Visual C++ compiler (e.g. community edition). After that then cython will find the correct compiler and build the shared objects with no problem.</div><div>So, in summary the steps are:</div><div>1. Install Anaconda for your windows version.</div><div>2. Install Visual C++ (or Studio) community edition (or other).</div><div>3. pip install nibabel</div><div>4. conda install vtk</div><div>5. cd dipy;</div><div>6. python setup.py develop (or python setup.py build_ext --inplace)</div><div><br></div><div>I hope this helps. We need to update our installation page! Cygwin/mingw is no more for anaconda users. We should also check what happens with Openmp when Visual C++ is used. </div><div><br></div><div>Many thanks to Jon for reporting the problem.</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div>Eleftherios</div><div><br></div><div><br></div><div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Sat, Jun 18, 2016 at 8:50 PM Eleftherios Garyfallidis <<a href="mailto:garyfallidis@gmail.com">garyfallidis@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Let's say just Saturday for now. Sunday is harder for me.<div>See you on Saturday at 11am EST.</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Eleftherios</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Jun 16, 2016 at 6:36 PM Jon Haitz Legarreta <<a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Dear Prof. Garyfallidis,<br></div>OK, I will then be around at that time on both Saturday and Sunday so that we can start the hangout when you send me the invitation.<br></div>See you then.<br><br></div>Again, thanks for your time Prof. Garyfallidis.<br><br></div>Sincerely,<br></div>JON HAITZ<br><br></div><div class="gmail_extra"></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" align="center" style="color:rgb(0,0,0);font-family:'Times New Roman';font-size:medium"><tbody><tr><td></td></tr></tbody></table><pre style="color:rgb(0,0,0);word-wrap:break-word;white-space:pre-wrap">--</pre><pre style="color:rgb(0,0,0);word-wrap:break-word;white-space:pre-wrap">Jon Haitz Legarreta Gorroño
Investigador / Researcher
eSalud y Aplicaciones Biomédicas / eHealth and Biomedical Applications
Vicomtech-IK4 - Visual Interaction Communication Technologies
Mikeletegi Pasealekua, 57 - Parque Tecnológico
20009 Donostia - San Sebastián - Spain
Tel: +[34] 943 30 92 30
Fax: +[34] 943 30 93 93
e-mail: <a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>
<a href="http://www.vicomtech.org" target="_blank">www.vicomtech.org</a>
*** member of IK4 Research Alliance ****
<a href="http://www.ik4.es" target="_blank">www.ik4.es</a>
*** member of GraphicsMedia.net ****
<a href="http://www.graphicsmedia.net" target="_blank">www.graphicsmedia.net</a>
-----------------------------------------------------
Vicomtech-IK4 is an ISO 9001:2000 certified institute
-----------------------------------------------------
Aviso Legal - Política de privacidad (<a href="http://www.vicomtech.org/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/proteccion-datos</a>)
Lege Oharra - Pribatutasun politika (<a href="http://www.vicomtech.org/eu/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/eu/proteccion-datos</a>)
Legal Notice - Privacy policy (<a href="http://www.vicomtech.org/en/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/en/proteccion-datos</a>)</pre><div><div dir="ltr"></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On 17 June 2016 at 00:29, Eleftherios Garyfallidis <span dir="ltr"><<a href="mailto:garyfallidis@gmail.com" target="_blank">garyfallidis@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Okay, thank you for letting me know. I will be travelling to Europe next Monday. Maybe the easiest will be to have a short meeting during the weekend let's say 11am EST. Otherwise, next week. But schedule for next week is still chaotic. I will be also in OHBM exhibition in Geneva. </div><div><div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Jun 16, 2016 at 6:24 PM Jon Haitz Legarreta <<a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>Dear Prof. Garyfallidis,<br></div>I have just been notified about a work meeting that will tentatively last until 10:00 EST, so I will not be able to make it. I am sorry Prof. Garyfallidis.<br></div><div><br>We will need to arrange the hangout for another day. I will be available through the weekend as well, but otherwise I am open to hold the hangout next week on either Monday, Tuesday or Wednesday between 8:00-12:00 EST.<br></div><div><br>If this suits you better, then great. Otherwise, we will need to postpone it.<br><br></div><div>Using google hangout is not an issue.<br></div><div><br></div><div>And yes, for the time we will be doing the hangout I will remove all Anaconda, nibabel and dipy so that we can start from a fresh installation.<br><br></div><div>Thanks for your patience and your time.<br><br></div><div>Sincerely,<br></div><div>JON HAITZ<br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><table style="color:rgb(0,0,0);font-family:'Times New Roman';font-size:medium" align="center" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td></td></tr></tbody></table><pre style="color:rgb(0,0,0);word-wrap:break-word;white-space:pre-wrap">--</pre><pre style="color:rgb(0,0,0);word-wrap:break-word;white-space:pre-wrap">Jon Haitz Legarreta Gorroño
Investigador / Researcher
eSalud y Aplicaciones Biomédicas / eHealth and Biomedical Applications
Vicomtech-IK4 - Visual Interaction Communication Technologies
Mikeletegi Pasealekua, 57 - Parque Tecnológico
20009 Donostia - San Sebastián - Spain
Tel: +[34] 943 30 92 30
Fax: +[34] 943 30 93 93
e-mail: <a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>
<a href="http://www.vicomtech.org" target="_blank">www.vicomtech.org</a>
*** member of IK4 Research Alliance ****
<a href="http://www.ik4.es" target="_blank">www.ik4.es</a>
*** member of GraphicsMedia.net ****
<a href="http://www.graphicsmedia.net" target="_blank">www.graphicsmedia.net</a>
-----------------------------------------------------
Vicomtech-IK4 is an ISO 9001:2000 certified institute
-----------------------------------------------------
Aviso Legal - Política de privacidad (<a href="http://www.vicomtech.org/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/proteccion-datos</a>)
Lege Oharra - Pribatutasun politika (<a href="http://www.vicomtech.org/eu/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/eu/proteccion-datos</a>)
Legal Notice - Privacy policy (<a href="http://www.vicomtech.org/en/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/en/proteccion-datos</a>)</pre><div><div dir="ltr"></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On 17 June 2016 at 00:04, Eleftherios Garyfallidis <span dir="ltr"><<a href="mailto:garyfallidis@gmail.com" target="_blank">garyfallidis@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Jon,<div><br></div><div>Apologies for the delay. I can hangout with you at 9am EST (EDT).</div><div><span style="line-height:1.5">It will have to be a relatively short meeting as I will have another meeting at 10am EST. I hope we can figure out a solution for you during this time.</span></div><div><span style="line-height:1.5"><br></span></div><div><span style="line-height:1.5">You may want to try to completely erase all previous installations both dipy, nibabel, and anaconda. So, you have a fresh system.</span></div><div><br></div><div><span style="line-height:1.5">I prefer to use google hangouts as we may need to screenshare.</span></div><div><span style="line-height:1.5"><br></span></div><div><span style="line-height:1.5">I hope this okay. </span></div><div><span style="line-height:1.5">Cheers,</span></div><div><span style="line-height:1.5">Eleftherios</span></div><div><br></div><div><br></div></div><div><div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Jun 16, 2016 at 5:38 PM Jon Haitz Legarreta <<a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Prof. Garyfallidis,<br></div>would you be available to do the hangout tomorrow morning, between 08:00-15:00 EDT?<br><br></div>Thank you.<br><br></div>Sincerely,<br></div>JON HAITZ<br><div><div><div><div><br clear="all"><div><div><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><table style="color:rgb(0,0,0);font-family:'Times New Roman';font-size:medium" align="center" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td></td></tr></tbody></table><pre style="color:rgb(0,0,0);word-wrap:break-word;white-space:pre-wrap">--</pre><pre style="color:rgb(0,0,0);word-wrap:break-word;white-space:pre-wrap">Jon Haitz Legarreta Gorroño
Investigador / Researcher
eSalud y Aplicaciones Biomédicas / eHealth and Biomedical Applications
Vicomtech-IK4 - Visual Interaction Communication Technologies
Mikeletegi Pasealekua, 57 - Parque Tecnológico
20009 Donostia - San Sebastián - Spain
Tel: +[34] 943 30 92 30
Fax: +[34] 943 30 93 93
e-mail: <a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>
<a href="http://www.vicomtech.org" target="_blank">www.vicomtech.org</a>
*** member of IK4 Research Alliance ****
<a href="http://www.ik4.es" target="_blank">www.ik4.es</a>
*** member of GraphicsMedia.net ****
<a href="http://www.graphicsmedia.net" target="_blank">www.graphicsmedia.net</a>
-----------------------------------------------------
Vicomtech-IK4 is an ISO 9001:2000 certified institute
-----------------------------------------------------
Aviso Legal - Política de privacidad (<a href="http://www.vicomtech.org/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/proteccion-datos</a>)
Lege Oharra - Pribatutasun politika (<a href="http://www.vicomtech.org/eu/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/eu/proteccion-datos</a>)
Legal Notice - Privacy policy (<a href="http://www.vicomtech.org/en/proteccion-datos" target="_blank">http://www.vicomtech.org/en/proteccion-datos</a>)</pre><div><div dir="ltr"></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote"></div></div></div></div></div></div></div><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername">Jon Haitz Legarreta</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>></span><br></div></div></div></div></div></div></div><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div class="gmail_quote">Date: 6 June 2016 at 00:16<br>Subject: Fwd: [dipy] [google hangout] Issues trying to install dipy<br>To: Eleftherios Garyfallidis <<a href="mailto:garyfallidis@gmail.com" target="_blank">garyfallidis@gmail.com</a>><br><br><br><div dir="ltr"><div><div><div>Dear Prof. Garyfallidis,<br>could we program the hangout to discuss about the dipy installation issues from sources at some point this or next week?<br><br>My availability would be as follows at this time:<br>Friday, June 10th: 08:00-15:00 EDT<br><div>Wednesday, June 15th: 9:00-15:00 EDT<br></div>Friday, June 17th: 08:00-15:00 EDT<br><br></div><div>Otherwise, I will be available through the weekend as well (except for this Saturday, June 11th).<br><br></div><div>I already posted the question to the Anaconda users' forum [1], but it got little attention from the community.<br><br></div>Thank you.<br><br></div>Sincerely,<br></div>JON HAITZ<br><div><div><div><br>[1] <a href="https://groups.google.com/a/continuum.io/forum/#!topic/anaconda/eQcYKQubSJ8" target="_blank">https://groups.google.com/a/continuum.io/forum/#!topic/anaconda/eQcYKQubSJ8</a><div>
<br><br><div class="gmail_quote"><span>---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername">Jon Haitz Legarreta</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:jhlegarreta@vicomtech.org" target="_blank">jhlegarreta@vicomtech.org</a>></span><br></span><div><div>Date: 1 June 2016 at 19:14<br>Subject: [dipy] [google hangout] Issues trying to install dipy<br>To: <a href="mailto:garyfallidis@gmail.com" target="_blank">garyfallidis@gmail.com</a><br><br><br><div dir="ltr"><div><div><div>Dear Prof. Garyfallidis,<br></div>first of all, thank you for your support and availability to try to fix the dipy installation issues I am experiencing.<br><br></div>Concerning your offer to have a google hangout, given my schedule, and the fact that the time shift between and Spain, where I am based, and Sherbrooke is 8 hours, my availability for the following days would be as follows:<br><br></div>Friday, June 3rd: 08:00-11:00 EDT<br><div><div><div>Wednesday, June 8th: 9:00-15:00 EDT<br></div><div>Friday, June 10th: 08:00-11:00 EDT<br><br></div><div>If this is too tight for your schedule, we could look for an alternative. I would also be available through this weekend. But, of course, I would understand that you preferred to have the google hangout during the week.<br><br></div><div>I look forward to your reply.<br><br></div><div>Sincerely,<br></div><div>Jon Haitz LEGARRETA<br><br> </div><div><br clear="all"><div><div><div><div><div><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><br></div></div></div></div></div>
</div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div><br></div></div></div></div></div>
</div></div></div></div></div></div></div></blockquote></div>
</div></div></blockquote></div><br></div></blockquote></div>
</div></div></blockquote></div><br></div></blockquote></div></blockquote></div></div></div>