<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Hi Ping,<br><br></div>Great to hear you're trying the toolbox!<br><br></div>Thanks for pointing out the bug, I just fixed it in the repository, so you should be able to load the gradient directions without having the error now.<br><br></div>Dmipy is completely general in that it can import any PGSE-based acquisition scheme with any number of non-diffusion weighted volumes. Dmipy internally normalizes the signal according to the mean of all b0-values, and automatically detects which measurements belong to the same acquisition shell.<br><br></div>Let me know if you have any more questions or just generally what your experience is using dmipy :-)<br><br></div>Best,<br></div>Rutger<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 21 April 2018 at 19:54, Ping-Hong Yeh <span dir="ltr"><<a href="mailto:pinghongyeh@gmail.com" target="_blank">pinghongyeh@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hi Rutger, </div><div><br></div>The failure was caused by multiple [ 0 0 0]  arrays in the gradient table that were used for acquiring non-diffusion weighted volumes. It started running after I modified the gradient  table by adding 1 to the z-direction of [ 0 0 0] to become [ 0 0 1]. <div>Can dmipy import the gradient DWI volumes with multiple non-diffusion weighted volumes interspersed in-between?</div><div><br></div><div>Thank you. </div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div><div>Ping</div><div><br></div></font></span></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Neuroimaging mailing list<br>
<a href="mailto:Neuroimaging@python.org">Neuroimaging@python.org</a><br>
<a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/<wbr>mailman/listinfo/neuroimaging</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>