<div dir="ltr"><div>Thank you Bennet, I'll wait for the next release then.</div><div>Best regards,</div><div>Mike<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sat, 6 Jul 2019 at 14:18, Bennet Fauber <<a href="mailto:bennet@umich.edu">bennet@umich.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Mike,<br>
<br>
I reported the blank plots in an Issue at GitHub.  I think there may<br>
be more that is needed before they make a new release and refresh the<br>
tutorial page.<br>
<br>
    <a href="https://github.com/nipy/nitime/pull/176" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/nipy/nitime/pull/176</a><br>
    <a href="https://github.com/nipy/nitime/issues/173" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/nipy/nitime/issues/173</a><br>
<br>
Sorry, can't help with the rest.<br>
<br>
On Fri, Jul 5, 2019 at 7:37 PM Mike V <<a href="mailto:mikeltv95@gmail.com" target="_blank">mikeltv95@gmail.com</a>> wrote:<br>
><br>
> Hello,<br>
><br>
> I'm following the Granger Causality tutorial in the nitime's webpage but I have few questions:<br>
><br>
> 1- In the tutorial the values f_ub = 0.15 and f_lb = 0.02 are used for the bounds on the frequency band of interest. Are these values recommended for all resting state data-sets or do they depend on the particular acquisition parameters?<br>
><br>
> 2- I do not understand the causality plots (fig03 and fig04), they are both blank. What does it mean? I was expecting some variation like in the coherence and correlation matrices...<br>
><br>
> 3- the tutorial shows the analysis of one single subject. How can I compute group statistics? Can I simply extract the values stored in g1 and then run a one sample t-test across all subjects' g1 scores?<br>
><br>
> 4- how can I get GrangerAnalyzer to display significance?<br>
><br>
> 5- I noticed that the tutorial data has been motion corrected only. Is it not necessary to correct for other sources of noise like physiological noise and linear drift before computing GC?<br>
><br>
> Many thanks in advance!<br>
><br>
> Best regards,<br>
> Mike<br>
> _______________________________________________<br>
> Neuroimaging mailing list<br>
> <a href="mailto:Neuroimaging@python.org" target="_blank">Neuroimaging@python.org</a><br>
> <a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging</a><br>
_______________________________________________<br>
Neuroimaging mailing list<br>
<a href="mailto:Neuroimaging@python.org" target="_blank">Neuroimaging@python.org</a><br>
<a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging</a><br>
</blockquote></div>