<div dir="auto"><div>Hello,<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">I think providing tools for multimodality would be great. The basic experimental use case is that we have several simultaneous imaging measures, eg fmri eeg and breathing. The first concern is to have a common container for neuroimaging data from different modalities. The second one is to conveniently handle temporal synchronization between measures and then interpolation on the same temporal grid.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">My one cent.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Thanks for all the great work on nibabel so far!</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Thomas.</div><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Le jeu. 30 juill. 2020 11 h 01, Matthew Brett <<a href="mailto:matthew.brett@gmail.com" target="_blank" rel="noreferrer">matthew.brett@gmail.com</a>> a écrit :<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
Although this is pushing things close the wire, I am currently trying<br>
to work out whether to apply for a Chan Zuckerberg grant for Nibabel:<br>
<br>
<a href="https://chanzuckerberg.com/wp-content/uploads/2020/06/EOSS-3-RFA-Announcement-and-Instructions-CYCLE-3-COMBINED-1.pdf" rel="noreferrer noreferrer noreferrer" target="_blank">https://chanzuckerberg.com/wp-content/uploads/2020/06/EOSS-3-RFA-Announcement-and-Instructions-CYCLE-3-COMBINED-1.pdf</a><br>
<br>
Before we do that, I wanted to ask - if y'all could get anything into<br>
Nibabel - what<br>
would it be?<br>
<br>
So far, in various conversations, Chris Markiewicz and I came up with:<br>
<br>
* More comprehensive DICOM to NIfTI etc support<br>
* Labelled axes for images, maybe via xarray<br>
* Integrated API for surface formats [1]<br>
* HDF5 serialization for many image formats<br>
* Ability to read images directly from URLs, read / write images to /<br>
from AWS, GCS, Azure data storage addresses [2]<br>
* Optimized visualization for web and desktop<br>
<br>
Is there anything else you'd like to see?<br>
<br>
See you,<br>
<br>
Matthew<br>
<br>
[1] <a href="https://github.com/nipy/nibabel/issues/936" rel="noreferrer noreferrer noreferrer" target="_blank">https://github.com/nipy/nibabel/issues/936</a><br>
[2] c.f. <a href="https://pandas.pydata.org/pandas-docs/version/1.1.0/whatsnew/v1.1.0.html#fsspec-now-used-for-filesystem-handling" rel="noreferrer noreferrer noreferrer" target="_blank">https://pandas.pydata.org/pandas-docs/version/1.1.0/whatsnew/v1.1.0.html#fsspec-now-used-for-filesystem-handling</a><br>
_______________________________________________<br>
Neuroimaging mailing list<br>
<a href="mailto:Neuroimaging@python.org" rel="noreferrer noreferrer" target="_blank">Neuroimaging@python.org</a><br>
<a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging" rel="noreferrer noreferrer noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailman/listinfo/neuroimaging</a><br>
</blockquote></div></div></div>