Hi Chris,<br> thanks much for posting those installation instructions.  Seems similar to what I pieced together.<br><br>I gather ATLAS not found.  Oops, drank that beer too early.<br><br>I copied Atlas libs to /usr/local/rich/src/scipy_build/lib.<br>
<br>This is my site.cfg.  Out of desperation I tried search_static_first = 1, but probably of no use.<br><br>[DEFAULT]<br>library_dirs = /usr/local/rich/src/scipy_build/lib:$HOME/usr/galois/lib<br>include_dirs = /usr/local/rich/src/scipy_build/lib/include:$HOME/usr/galois/include<br>
search_static_first = 1<br><br>[blas_opt]<br>libraries = f77blas, cblas, atlas<br><br>[lapack_opt]<br>libraries = lapack, f77blas, cblas, atlas<br><br>[amd]<br>amd_libs = amd<br><br>[umfpack]<br>umfpack_libs = umfpack, gfortran<br>
<br>[fftw]<br>libraries = fftw3<br><br><br>Rich<br><br><br><br><br><div class="gmail_quote">On Sat, Jun 6, 2009 at 10:25 AM, Chris Colbert <span dir="ltr"><<a href="mailto:sccolbert@gmail.com">sccolbert@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">when you build numpy, did you use site.cfg to tell it where to find<br>
your atlas libs?<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
On Sat, Jun 6, 2009 at 1:02 PM, Richard Llewellyn<<a href="mailto:llewelr@gmail.com">llewelr@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Hello,<br>
><br>
> I've managed a build of lapack and atlas on Fedora 10 on a quad core, 64,<br>
> and now (...) have a numpy I can import that runs tests ok. :]    I am<br>
> puzzled, however, that numpy builds and imports lapack_lite.  Does this mean<br>
> I have a problem with the build(s)?<br>
> Upon building numpy, I see the troubling output:<br>
><br>
> ########################<br>
><br>
> C compiler: gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -O2 -g -pipe -Wall<br>
> -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protecto<br>
> r --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic -D_GNU_SOURCE -fPIC -fPIC<br>
><br>
> compile options: '-c'<br>
> gcc: _configtest.c<br>
> gcc -pthread _configtest.o -L/usr/local/rich/src/scipy_build/lib -llapack<br>
> -lptf77blas -lptcblas -latlas -o _configtest<br>
> /usr/bin/ld: _configtest: hidden symbol `__powidf2' in<br>
> /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.3.2/libgcc.a(_powidf2.o) is reference<br>
> d by DSO<br>
> /usr/bin/ld: final link failed: Nonrepresentable section on output<br>
> collect2: ld returned 1 exit status<br>
> /usr/bin/ld: _configtest: hidden symbol `__powidf2' in<br>
> /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.3.2/libgcc.a(_powidf2.o) is reference<br>
> d by DSO<br>
> /usr/bin/ld: final link failed: Nonrepresentable section on output<br>
> collect2: ld returned 1 exit status<br>
> failure.<br>
> removing: _configtest.c _configtest.o<br>
> Status: 255<br>
> Output:<br>
>   FOUND:<br>
>     libraries = ['lapack', 'ptf77blas', 'ptcblas', 'atlas']<br>
>     library_dirs = ['/usr/local/rich/src/scipy_build/lib']<br>
>     language = f77<br>
>     define_macros = [('NO_ATLAS_INFO', 2)]<br>
><br>
> ##########################<br>
><br>
> I don't have root on this machine, but could pester admins for eventual<br>
> temporary access.<br>
><br>
> Thanks much for any help,<br>
> Rich<br>
><br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Numpy-discussion mailing list<br>
> <a href="mailto:Numpy-discussion@scipy.org">Numpy-discussion@scipy.org</a><br>
> <a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/numpy-discussion" target="_blank">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/numpy-discussion</a><br>
><br>
><br>
_______________________________________________<br>
Numpy-discussion mailing list<br>
<a href="mailto:Numpy-discussion@scipy.org">Numpy-discussion@scipy.org</a><br>
<a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/numpy-discussion" target="_blank">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/numpy-discussion</a><br>
</blockquote></div><br>