Hi,<br><br>  I have been using h5py a lot (both on windows and Mac OSX)  and can only recommend it- haven't tried the other options though....<br><br> Cheers,<br> Simon<br><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jun 21, 2011 at 8:24 PM, Derek Homeier <span dir="ltr"><<a href="mailto:derek@astro.physik.uni-goettingen.de">derek@astro.physik.uni-goettingen.de</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div class="im">On 21.06.2011, at 7:58PM, Neal Becker wrote:<br>
<br>
> I think, in addition, that hdf5 is the only one that easily interoperates with<br>
> matlab?<br>
><br>
> speaking of hdf5, I see:<br>
><br>
> pyhdf5io  0.7 - Python module containing high-level hdf5 load and save<br>
> functions.<br>
> h5py  2.0.0 - Read and write HDF5 files from Python<br>
><br>
> Any thoughts on the relative merits of these?<br>
<br>
</div>In my experience, HDF5 access usually approaches disk access speed, and random access to sub-datasets should be significantly faster than reading in the entire file, though I have not been able to test this.<br>
I have not heard about pyhdf5io (how does it work together with numpy?) - as alternative to h5py I'd rather recommend pytables, though I prefer the former for its cleaner/simpler interface (but that probably depends on your programming habits).<br>

<br>
HTH,<br>
<font color="#888888">                                                Derek<br>
</font><div><div></div><div class="h5"><br>
_______________________________________________<br>
NumPy-Discussion mailing list<br>
<a href="mailto:NumPy-Discussion@scipy.org">NumPy-Discussion@scipy.org</a><br>
<a href="http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/numpy-discussion" target="_blank">http://mail.scipy.org/mailman/listinfo/numpy-discussion</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>