<div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 30, 2013 at 3:51 PM, Christoph Gohlke <span dir="ltr"><<a href="mailto:cgohlke@uci.edu" target="_blank">cgohlke@uci.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><br>
<br>
On 9/30/2013 11:02 AM, Nathaniel Smith wrote:> Everyone please do<br>
<div class="im">actually test this! It is really in your best<br>
> interest, and I think people don't always realize this.<br>
><br>
> Here's how it works:<br>
> - If you test it *now*, and it breaks your code that worked with 1.7,<br>
> and you *tell* us this now, then it's *our* problem and we hold up the<br>
> release to fix the bug.<br>
> - If you test it *after* we release, and it breaks your code, then we<br>
> are sad but you have to work around it (because we can't magically<br>
> make that release not have happened, your users will be using it<br>
> anyway), and we put it on the stack with all the other bugs. All of<br>
> which we care about but it's a large enough stack that it's not going<br>
> to get any special priority, because, see above about how at this<br>
> point you'll have had to work around it anyway.<br>
><br>
> -n<br>
><br>
> On Mon, Sep 30, 2013 at 4:17 PM, Charles R Harris<br>
> <<a href="mailto:charlesr.harris@gmail.com">charlesr.harris@gmail.com</a>> wrote:<br>
>> Hi All,<br>
>><br>
>> NumPy 1.8.0rc1 is up now on sourceforge .The binary builds are included<br>
>> except for Python 3.3 on windows, which will arrive later. Many thanks to<br>
>> Ralf for the binaries, and to those who found and fixed the bugs in the last<br>
>> beta. Any remaining bugs are all my fault ;) I hope this will be the last<br>
>> release before final, so please test it thoroughly.<br>
>><br>
>> Chuck<br>
<br>
<br>
</div>Hello,<br>
<br>
NumPy 1.8.0rc1 looks good. All tests pass on Windows and most 3rd party<br>
packages test OK now. Thank you.<br>
<br>
A few tests still fail in the following packages when run with<br>
numpy-MKL-1.8.0rc1-win-amd64-py3.3 compared to<br>
numpy-MKL-1.7.1-win-amd64-py3.3:<br>
<br>
1) Pandas 0.12.0<br>
<br>
```<br>
======================================================================<br>
FAIL: test_nansum_buglet (pandas.tests.test_series.TestNanops)<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
Traceback (most recent call last):<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\pandas\tests\test_series.py",<br>
line 254, in test_nansum_buglet<br>
     assert_almost_equal(result, 1)<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\pandas\util\testing.py", line<br>
134, in assert_almost_equal<br>
     np.testing.assert_(isiterable(b))<br>
   File "D:\Dev\Compile\Test\numpy-build\numpy\testing\utils.py", line<br>
44, in assert_<br>
     raise AssertionError(msg)<br>
AssertionError<br>
```<br>
<br>
Possibly related:<br>
<br>
```<br>
>>> import numpy as np<br>
>>> from pandas import Series<br>
>>> s = Series([0.0])<br>
>>> result = np.nansum(s)<br>
>>> print(result)<br>
Traceback (most recent call last):<br>
   File "<stdin>", line 1, in <module><br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\pandas\core\base.py", line 19, in<br>
__str__<br>
     return self.__unicode__()<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\pandas\core\series.py", line<br>
1115, in __unicode__<br>
     length=len(self) > 50,<br>
TypeError: len() of unsized object<br>
```<br>
<br>
2) Bottleneck 0.7.0<br>
<br>
<a href="https://github.com/kwgoodman/bottleneck/issues/71#issuecomment-25331701" target="_blank">https://github.com/kwgoodman/bottleneck/issues/71#issuecomment-25331701</a><br>
<br>
3) skimage 0.8.2<br>
<br>
These tests passed with numpy 1.8.0b2:<br>
<br>
```<br>
======================================================================<br>
FAIL: test_grey.test_non_square_image<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
Traceback (most recent call last):<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\nose\case.py", line 198, in runTest<br>
     self.test(*self.arg)<br>
   File<br>
"X:\Python33\lib\site-packages\skimage\morphology\tests\test_grey.py",<br>
line 162, in test_non_square_image<br>
     testing.assert_array_equal(binary_res, grey_res)<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
718, in assert_array_equal<br>
     verbose=verbose, header='Arrays are not equal')<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
644, in assert_array_compare<br>
     raise AssertionError(msg)<br>
AssertionError:<br>
Arrays are not equal<br>
<br>
(mismatch 50.6328125%)<br>
  x: array([[False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],...<br>
  y: array([[ True,  True,  True, ...,  True, False, False],<br>
        [ True,  True,  True, ..., False, False, False],<br>
        [ True,  True,  True, ..., False, False, False],...<br>
<br>
======================================================================<br>
FAIL: test_grey.test_binary_erosion<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
Traceback (most recent call last):<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\nose\case.py", line 198, in runTest<br>
     self.test(*self.arg)<br>
   File<br>
"X:\Python33\lib\site-packages\skimage\morphology\tests\test_grey.py",<br>
line 169, in test_binary_erosion<br>
     testing.assert_array_equal(binary_res, grey_res)<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
718, in assert_array_equal<br>
     verbose=verbose, header='Arrays are not equal')<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
644, in assert_array_compare<br>
     raise AssertionError(msg)<br>
AssertionError:<br>
Arrays are not equal<br>
<br>
(mismatch 48.260498046875%)<br>
  x: array([[False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],...<br>
  y: array([[ True,  True,  True, ...,  True, False, False],<br>
        [ True,  True,  True, ..., False, False, False],<br>
        [ True,  True,  True, ..., False, False, False],...<br>
<br>
======================================================================<br>
FAIL: test_grey.test_binary_closing<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
Traceback (most recent call last):<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\nose\case.py", line 198, in runTest<br>
     self.test(*self.arg)<br>
   File<br>
"X:\Python33\lib\site-packages\skimage\morphology\tests\test_grey.py",<br>
line 183, in test_binary_closing<br>
     testing.assert_array_equal(binary_res, grey_res)<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
718, in assert_array_equal<br>
     verbose=verbose, header='Arrays are not equal')<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
644, in assert_array_compare<br>
     raise AssertionError(msg)<br>
AssertionError:<br>
Arrays are not equal<br>
<br>
(mismatch 66.302490234375%)<br>
  x: array([[False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],...<br>
  y: array([[ True,  True,  True, ...,  True,  True,  True],<br>
        [ True,  True,  True, ...,  True,  True,  True],<br>
        [ True,  True,  True, ..., False, False, False],...<br>
<br>
======================================================================<br>
FAIL: test_grey.test_binary_opening<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
Traceback (most recent call last):<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\nose\case.py", line 198, in runTest<br>
     self.test(*self.arg)<br>
   File<br>
"X:\Python33\lib\site-packages\skimage\morphology\tests\test_grey.py",<br>
line 190, in test_binary_opening<br>
     testing.assert_array_equal(binary_res, grey_res)<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
718, in assert_array_equal<br>
     verbose=verbose, header='Arrays are not equal')<br>
   File "X:\Python33\lib\site-packages\numpy\testing\utils.py", line<br>
644, in assert_array_compare<br>
     raise AssertionError(msg)<br>
AssertionError:<br>
Arrays are not equal<br>
<br>
(mismatch 58.465576171875%)<br>
  x: array([[False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],<br>
        [False, False, False, ..., False, False, False],...<br>
  y: array([[ True,  True,  True, ...,  True,  True, False],<br>
        [ True,  True,  True, ...,  True,  True, False],<br>
        [ True,  True,  True, ..., False, False, False],...<br>
```<span class=""><font color="#888888"><br></font></span></blockquote><div> </div><div>I'll bet the skimage problems come from <a href="https://github.com/numpy/numpy/pull/3811">https://github.com/numpy/numpy/pull/3811</a>. They may be doing something naughty...<br>
<br></div><div>Chuck <br></div><br></div></div></div>