<div class="gmail_quote">On Sat, Jul 4, 2009 at 9:51 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:amrita@iisermohali.ac.in">amrita@iisermohali.ac.in</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Hi,<br>
<br>
I want to know that whether using python programming is it possible to<br>
extract chemical shift information about some amino acids of some protein<br>
from BMRB(BioMagResBank) or Ref-DB(referenced databank) or not.<br>
<br>
Thanks,<br>
Amrita Kumari<br>
Research Fellow<br>
IISER Mohali<br>
Chandigarh<br>
INDIA<br>
<font color="#888888"><font class="Apple-style-span" color="#000000"><font class="Apple-style-span" color="#888888"></font></font></font></blockquote><div><br></div><div>Without any real knowledge of the problem domain, but with keyword level google search, here's one one finds --</div>
<div><a href="http://www.ccpn.ac.uk/api-documentation/ccpnmr/ccpnmr2.0/python/doc/api.html">http://www.ccpn.ac.uk/api-documentation/ccpnmr/ccpnmr2.0/python/doc/api.html</a></div><div><a href="http://www.ccpn.ac.uk/api-documentation/ccpnmr/ccpnmr2.0/python/doc/api.html"></a><a href="http://biopython.org/wiki/Main_Page">http://biopython.org/wiki/Main_Page</a></div>
<div><a href="http://biopython.org/wiki/Main_Page"></a><a href="http://chempython.org/">http://chempython.org/</a></div><div><a href="http://chempython.org/"></a><a href="http://www.sschwarzer.net/">http://www.sschwarzer.net/</a> </div>
</div><div><br></div>Also as Grant says, if you can create a software program in any language, you can potentially do it with Python as well. As Python is a "batteries included" language, chances are, the included-batteries would make your life easier. Of course mileage may vary. If you find existing modules that do much of what you want, you have a very good starting point.<br>
-- <br>regards,<br>Banibrata<br><a href="http://www.linkedin.com/in/bdutta">http://www.linkedin.com/in/bdutta</a><br>