Dear Sir,<br />
<br />
Thanks for your help..........but yes my files are having column like:<br />
<br />
#  RESIDUE AA STRUCTURE BP1 BP2  ACC     N-H-->O    O-->H-N    N-H-->O    O-->H-N    TCO  KAPPA ALPHA  PHI   PSI    X-CA   Y-CA   Z-CA <br />
    1    2 A I              0   0   91      0, 0.0    38,-0.1     0, 0.0     5,-0.0   0.000 360.0 360.0 360.0 156.1   38.1   24.6   -5.0<br />
    2    3 A R    >>  -     0   0   86      1,-0.1     4,-1.8    38,-0.1     3,-1.0  -0.377 360.0-116.9 -66.2 144.2   35.1   25.2   -7.3<br />
    3    4 A P  H 3> S+     0   0   81      0, 0.0     4,-2.7     0, 0.0     5,-0.2   0.843 111.7  60.4 -55.3 -36.8   34.6   28.8   -8.2<br />
<br />
and in the output I want just:<br />
2 A I<br />
3 A R    >>  -<br />
4 A P  H 3> S+<br />
<br />
i.e. residue no., aa and seconday structure.<br />
<br />
Thanks<br />
 <br />
<br />
On Mon, 26 Apr 2010 20:40:55 +0530  wrote<br />
>mannu jha wrote:<br />
<br />
> Dear all,<br />
<br />
><br />
<br />
> I am new in python, can anyone help me that how can I select two <br />
<br />
> column out of 6 column from a file.<br />
<br />
> For example if I have file like:<br />
<br />
><br />
<br />
> a1 a2 a3 a4 a5 a6<br />
<br />
> b1 b2 b3 b4 b5 b6<br />
<br />
> c1 c2 c3 c4 c5 c6<br />
<br />
> d1 d2 d3 d4 d5 d6<br />
<br />
><br />
<br />
> and I want output like:<br />
<br />
><br />
<br />
> a1 a4<br />
<br />
> b1 b4<br />
<br />
> c1 c4<br />
<br />
> d1 d4<br />
<br />
><br />
<br />
> then how to do<br />
<br />
><br />
<br />
> Thanks <br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Do you know how to open a file, and how to read individual lines from it?<br />
<br />
<br />
<br />
If so, then you can split a line at the spaces into a list by using<br />
<br />
 fields = line.split()<br />
<br />
Then<br />
<br />
 print fields[0], fields[3]<br />
<br />
would do what you ask.<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Gary Herron<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
-- <br />
<br />
http://mail.python.org/mailman/listinfo/python-list<br />
<br />