Problema con .exe y urlopen

[lars]

Hola, tengo un problema con un script que baja archivos, los archivos 
comprimidos a veces los baja bien y a veces los baja mal (que cosas), 
pero con los archivos .exe no hay manera, pego la funcion en cuestion:

def descarga(dep):
    [...]
    input = urlopen(inst[dep][0]) # ruta completa del archivo en el 
servidor p.e. http://www.servidor.com/dir1/dir2/archivo.exe
    output = file(ruta+'\\test', 'w')
    output.write(input.read())
    input.close()
    output.close()

Bastante cutre, es esta la forma para bajar archivos? se os ocurre algo 
mejor? donde esta el fallo?

Gracias.