<div dir="ltr">Dear Roman,<div><br></div><div>I tried to search through on the web but i didn't get any information or example. <br></div><div><br></div><div>Could you give me an example of using <span style="font-size:12.8px">_CFNode.centroids_?</span><br></div><div><br></div><div>I would appreciate it if you would help me.<br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 23, 2017 at 2:28 PM, Roman Yurchak <span dir="ltr"><<a href="mailto:rth.yurchak@gmail.com" target="_blank">rth.yurchak@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="">> what are the data samples in this cluster<br>
<br></span>
Mehmet's response below works for exploring the hierarchical tree. However, Birch currently doesn't store the data samples that belong to a given subcluster. If you need that, as far as I know, a reasonable approximation can be obtained by computing the data samples that are closest to the centroid of the considered subcluster (accessible via _CFNode.centroids_) as compared to all other subcluster centroids at this hierarchical tree depth.<br>
<br>
Alternatively, the modifications in PR <a href="https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/pull/8808" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/scikit-lear<wbr>n/scikit-learn/pull/8808</a> aimed to make this process easier..<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
-- <br>
Roman</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
On 23/08/17 13:44, Suzen, Mehmet wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi Sema,<br>
<br>
You can access CFNode from the fit output, assign fit output, so you<br>
can have the object.<br>
<br>
brc_fit = brc.fit(X)<br>
brc_fit_cfnode = brc_fit.root_<br>
<sklearn.cluster.birch._CFNode object at 0x7ff31acbf668><br>
<br>
Then you can access CFNode, see here<br>
<a href="https://kite.com/docs/python/sklearn.cluster.birch._CFNode" rel="noreferrer" target="_blank">https://kite.com/docs/python/s<wbr>klearn.cluster.birch._CFNode</a><br>
<br>
Also, this example comparing mini batch kmeans.<br>
<a href="http://scikit-learn.org/stable/auto_examples/cluster/plot_birch_vs_minibatchkmeans.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://scikit-learn.org/stable<wbr>/auto_examples/cluster/plot_<wbr>birch_vs_minibatchkmeans.html</a><br>
<br>
Hope this was what you are after.<br>
<br>
Best,<br>
Mehmet<br>
<br>
On 23 August 2017 at 10:55, Sema Atasever <<a href="mailto:s.atasever@gmail.com" target="_blank">s.atasever@gmail.com</a>> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Dear scikit-learn members,<br>
<br>
Considering the "CF-tree" data structure :<br>
<br>
- How can i access Clustering Feature Tree in Birch?<br>
<br>
- For example, how many clusters are there in the hierarchy under the root<br>
node and what are the data samples in this cluster?<br>
<br>
- Can I get them separately for 3 trees?<br>
<br>
Best.<br>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
scikit-learn mailing list<br>
<a href="mailto:scikit-learn@python.org" target="_blank">scikit-learn@python.org</a><br>
<a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/scikit-learn" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailma<wbr>n/listinfo/scikit-learn</a><br>
<br>
</blockquote>
______________________________<wbr>_________________<br>
scikit-learn mailing list<br>
<a href="mailto:scikit-learn@python.org" target="_blank">scikit-learn@python.org</a><br>
<a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/scikit-learn" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailma<wbr>n/listinfo/scikit-learn</a><br>
<br>
</blockquote>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
scikit-learn mailing list<br>
<a href="mailto:scikit-learn@python.org" target="_blank">scikit-learn@python.org</a><br>
<a href="https://mail.python.org/mailman/listinfo/scikit-learn" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.python.org/mailma<wbr>n/listinfo/scikit-learn</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>