I&#39;m trying to improve my python by translating R code that I wrote into Python.  I&#39;ve been reading about the python csv module and realized it was best to get some expert input to clarify some confusion on my part.  As background, GSEXXXXX_full_pdata.csv has different patient information (such as unique patient ID&#39;s, whether the tissue used was tumor or normal, and other things. I&#39;ll just use the first two characteristics for now).  Template.csv is a template we built that allows us to take different datasets and standardize them for meta-analysis.  So for example, &quot;curated$alt_sample_name&quot; refers to the unique patient ID, and &quot;curated$sample_type&quot; refers to the type of tissue used.  Here is sample code in R.  <div>
<br></div><div><div>uncurated &lt;- read.csv(&quot;../uncurated/GSEXXXXX_full_pdata.csv&quot;,<a href="http://as.is">as.is</a>=TRUE,row.names=1)</div><div><br></div><div>##initial creation of curated dataframe</div><div>curated &lt;- initialCuratedDF(rownames(uncurated),template.filename=&quot;template.csv&quot;)</div>
<div><br></div><div><br></div><div>##--------------------</div><div>##start the mappings</div><div>##--------------------</div><div><br></div><div>##title -&gt; alt_sample_name</div><div>tmp &lt;- uncurated$title</div><div>
curated$alt_sample_name &lt;- tmp</div><div><br></div><div>##sample_type are all tumor</div><div>curated$sample_type &lt;- &quot;tumor&quot;</div><div>_________________________________________________________________</div>
<div>In Python, I have figured out how to assign &quot;uncurated&quot; and &quot;curated&quot; to the correct paths.  <b>My trouble arose when trying to execute the following R code:</b></div><div><br></div><div><div>##title -&gt; alt_sample_name</div>
<div>tmp &lt;- uncurated$title</div><div>curated$alt_sample_name &lt;- tmp</div></div><div><br></div><div><b>All I am trying to do is take in a specific column in &quot;uncurated&quot; and write that whole column as output to &quot;curated.&quot; It should be a pretty basic command, I&#39;m just not clear on how to execute it.</b></div>
<div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>benjamin</div><div><br></div></div>